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asa:lecture [2021/06/17 09:37] – [Vorlesungsfolien] ingoasa:lecture [2022/08/01 15:42] (current) – ingo
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 ====== Algorithmen in der Sequenzanalyse - Vorlesungsmaterial ====== ====== Algorithmen in der Sequenzanalyse - Vorlesungsmaterial ======
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 +<WRAP round box>
 +Video zur Vorlesung 7 - Alignment
 +{{ :asa:2022:asa_lecture-7.mp4 |}}
 +</WRAP>
 +/*
 Im folgenden finden Sie die Aufzeichnungen der Vorlesungen((Manchmal hilft es die Grundlagen ein wenig aufzufrischen. Entsprechend haben wir auch den Link der Grundlagenvorlesung angefügt)) und die verwendeten Folien. Diese Materialen sind nur für ihren persönlichen Gebrauch vorgesehen! Eine Weiterverbreitung - auch in Auszügen - ist ohne explizite Zustimmung untersagt! Im folgenden finden Sie die Aufzeichnungen der Vorlesungen((Manchmal hilft es die Grundlagen ein wenig aufzufrischen. Entsprechend haben wir auch den Link der Grundlagenvorlesung angefügt)) und die verwendeten Folien. Diese Materialen sind nur für ihren persönlichen Gebrauch vorgesehen! Eine Weiterverbreitung - auch in Auszügen - ist ohne explizite Zustimmung untersagt!
  
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    - Vorlesung 6 - RNAseq and splice-aware mapping <WRAP box>{{ :asa:2021:lecture:video:asa2021-v6.mp4 |RNA seq and splice-aware mapping}}</WRAP>    - Vorlesung 6 - RNAseq and splice-aware mapping <WRAP box>{{ :asa:2021:lecture:video:asa2021-v6.mp4 |RNA seq and splice-aware mapping}}</WRAP>
    - Vorlesung 7 - Alignments <WRAP box>{{ :asa:2021:lecture:video:asa2021-v7.mp4 |Alignment}}</WRAP>    - Vorlesung 7 - Alignments <WRAP box>{{ :asa:2021:lecture:video:asa2021-v7.mp4 |Alignment}}</WRAP>
-   - Vorlesung 8 - Modelle und pHMMs <WRAP box>{{ :asa:2021:lecture:video:asa2021-v8-pHMMs.mp4 |pHMMs}}</WRAP>+   - Vorlesung 8 - Models and pHMMs <WRAP box>{{ :asa:2021:lecture:video:asa2021-v8-pHMMs.mp4 |pHMMs}}</WRAP> 
 +   - Vorlesung 9 - pHMM and Dirchilet mixtures <WRAP box>{{ :asa:2021:lecture:video:asa2021-V09.mp4 |pHMMs}}</WRAP> 
 +   - Vorlesung 10 - Simulation of sequence evolution and Phylogenetic tree reconstruction <WRAP box>{{ :asa:2021:lecture:video:asa2021-V10.mp4 |pHMMs}}</WRAP> 
 +   - Vorlesung 11 - Algorithms in orthology assignment <WRAP box>{{ :asa:2021:lecture:video:asa2021-V11.mp4 |Orthology}}</WRAP>
 ===== Vorlesungsfolien ===== ===== Vorlesungsfolien =====
  
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   - {{ :asa:2021:lecture:slides:asa_lecture6-rnaseq.pdf |Vorlesung 6 - RNAseq and splice-aware mapping}}   - {{ :asa:2021:lecture:slides:asa_lecture6-rnaseq.pdf |Vorlesung 6 - RNAseq and splice-aware mapping}}
   - {{ :asa:2021:lecture:slides:asa_lecture7-alignment.pdf |Vorlesung 7 - Alignments}}   - {{ :asa:2021:lecture:slides:asa_lecture7-alignment.pdf |Vorlesung 7 - Alignments}}
-  - {{ :asa:2021:lecture:slides:asa_lecture8-models.pdf |Vorlesung 7 - Alignments}}+  - {{ :asa:2021:lecture:slides:asa_lecture8-models.pdf |Vorlesung 8 - Models and pHMMs}} 
 +  - {{ :asa:2021:lecture:slides:asa_lecture9-dirichlet.pdf |Vorlesung 9 - pHMMs and Dirichlet Mixtures}} 
 +  - {{ :asa:2021:lecture:slides:asa_lecture10_trees.pdf|Vorlesung 10 - Simulation of Seq. Evolution / Algorithms in phylogenetic tree reconstruction}} 
 +  - {{ :asa:2021:lecture:slides:asa_lecture11-orthology.pdf|Vorlesung 11 - Algorithms in Orthology Assignments}}
 /*     - {{:wiki:2019:asa_lecture6_rnaseq_alternativesplicing.pdf|Vorlesung 6 - RNA seq analysis}} /*     - {{:wiki:2019:asa_lecture6_rnaseq_alternativesplicing.pdf|Vorlesung 6 - RNA seq analysis}}
    - {{:wiki:2019:asa_lecture7-alignment.pdf|Vorlesung 7 - Alignment}}    - {{:wiki:2019:asa_lecture7-alignment.pdf|Vorlesung 7 - Alignment}}
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